这次专项清查工作的范围是安排和使用涉农卫生专项资金的市、县卫生部门和有关医疗卫生单位。主要检查2007年至2009年各级财政预算安排用于农村医疗卫生事业和新农合的各项补助资金的使用管理情况。重点检查四方面资金：各级政府对农村医疗卫生基础设施建设投入资金；各级政府对新农合补助资金；各级政府安排公共卫生专项资金；基层医药卫生体制综合改革专项资金。各级卫生部门要对管理范围内的涉农卫生专项资金安排和使用情况进行逐一清理，并进行统计填报。

　　省卫生厅要求，此次清查要特别注意检查和纠正以下问题：涉农卫生专项资金管理制度是否完善；对乡镇卫生院和村卫生室及乡医各项补助资金是否及时足额拨付到位；是否存在多头申报、虚报冒领、套取涉农卫生资金的问题；是否存在截留、挤占、挪用涉农卫生专项资金的问题；是否存在滞留上级拨付专款、资金使用效率较低的问题；财政预算安排的涉农卫生专项资金相关账户设置和资金划转存在的问题等。